As Tomato Brown Rugose Fruit Virus ynfektearret tomaten- en piperplanten oer de heule wrâld, wurkje siedbedriuwen oan it fokken fan in resistente tomaat.
Rike genetyske en genomyske boarnen wiene te krijen foar tomatefokkers noch foar it begjin fan de genomyske folchoarderprojekten fan de tomato. Grutte tomaten germplasmekolleksjes binne al lang fêstige op ferskate lokaasjes. Mear dan 75,000 tagongsrjochten foar tomaten wurde bewarre yn genebanken oer de heule wrâld. Ien fan 'e grutste is de USDA genebank yn Genève, NY.
Folchoarder fan it tomaatgenoom waard yn 2005 inisjearre as in multinasjonale ynspanning tusken 14 lannen en foltôge yn 2012. Dizze ynspanningen binne flink fersneld mei de tapassing fan keunstmjittige yntelliginsje, masine learen en avansearre algoritmen om grutte hoemannichten genetyske en fenotypyske gegevens te analysearjen.
Tomaat Pan-Genoom
Undersikers fan it Boyce Thompson Institute yn 2020 makken in referinsjegenoom fan hege kwaliteit foar wylde tomaten om in folsleiner en nuttiger tomatenpan-genoom te produsearjen. Se ûntdutsen seksjes fan it genoom dy't ûnderlizze foar fruitaroma, grutte en rypjen, stresstolerânsje en ferset tsjin sykte. Mei tank oan heulendalige sequinsjetechnologyen dy't heul lange stikken DNA lêze kinne, is it referinsjegenoom folsleiner en krekter dan de besteande databank.
Aldere sequinsjetechnologyen dy't koartere stikjes DNA lêze, identifisearje mutaasjes op it basisnivo fan ien basis. Se binne lykwols net goed yn it finen fan strukturele farianten lykas ynstekken, wiskingen, ynversjes as duplikaasjes fan grutte brokken DNA.
Yn 2019 konstruearre in ynternasjonale groep ûndersikers in tomatenpan-genom troch gebrûk te meitsjen fan genoomsekwinsjes fan 725 fylogenetyske en geografysk represintative farianten. Dizze databank befettet 4,873 genen dy't net binne fûn yn it orizjinele referinsjegenoom. Oanwêzige / ôfwêzige fariaasjeanalyses lieten substansjeel genferlies en intense negative seleksje fan genen en promotors sjen by domestisearring en ferbettering fan tomaten.
Lês it folsleine artikel op www.seedworld.com.